Cependant, le faible coût des applications proposées au sein de l'AppStore ne plaît pas à tout le monde. En effet, l'analyste Jeff Orr explique : « certains estiment qu'Apple casse le marché avec son AppStore ». En moyenne, une application serait 1 à 2 dollars moins chère au travers de la boutique d'iTunes. Sur les autres plateformes marchandes, le prix du logiciel est situé entre 7 et 25 dollars.
La plupart des développeurs devront choisir entre toucher un large public et commercialiser leur création à prix cassé via l'AppStore en recevant 70% du prix de vente ou s'orienter vers d'autres boutiques moins fréquentées et toucher une commission plus intéressante. Jeff Orr précise cependant que l'effet iPhone a contribué à booster les ventes des applcations tierces des autres fabricants. D'ailleurs, suite au succès de l'AppStore, la plupart des fabricants ont entrepris d'ouvrir leur propres boutique comme Research in Motion, Microsoft, Android, Nokia, Samsung ou encore Sony Ericsson.
